Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNA2P51530 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNA2P51530 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNA2P51530 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNA2P51530 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNA2P51530 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNA2P51530 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNA2P51530 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNA2P51530 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNA2P51530 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNA2P51530 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNA2P51530 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNA2P51530 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNA2P51530 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DNA2P51530 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNA2P51530 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNA2P51530 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNA2P51530 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNA2P51530 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNA2P51530 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNA2P51530 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNA2P51530 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNA2P51530 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNA2P51530 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNA2P51530 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DNA2P51530 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNA2P51530 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNA2P51530 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms