Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT8P50990 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT8P50990 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT8P50990 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT8P50990 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT8P50990 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT8P50990 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT8P50990 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT8P50990 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT8P50990 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT8P50990 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT8P50990 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT8P50990 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT8P50990 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT8P50990 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT8P50990 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCT8P50990 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCT8P50990 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCT8P50990 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCT8P50990 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8P50990 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8P50990 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8P50990 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8P50990 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8P50990 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8P50990 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8P50990 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8P50990 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8P50990 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8P50990 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8P50990 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8P50990 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCT8P50990 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCT8P50990 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms