Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNTBP49356 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNTBP49356 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNTBP49356 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNTBP49356 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTBP49356 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTBP49356 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTBP49356 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTBP49356 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms