Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALDH9A1P49189 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALDH9A1P49189 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms