Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NRIP1P48552 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRIP1P48552 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms