Protein–RNA interactions for Protein: P46965

SPC1, Signal peptidase complex subunit SPC1, yeastyeast

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC1P46965 YJL007CYJL007C 315 nt-0.67□□□□□ -2.52
SPC1P46965 RPS30AYLR287C-A 192 nt-0.67□□□□□ -2.52
SPC1P46965 RSM23YGL129C 1353 nt-0.68□□□□□ -2.52
SPC1P46965 SPO21YOL091W 1830 nt-0.68□□□□□ -2.52
SPC1P46965 YDR269CYDR269C 324 nt-0.68□□□□□ -2.52
SPC1P46965 YHR054CYHR054C 1065 nt-0.68□□□□□ -2.52
SPC1P46965 LRP1YHR081W 555 nt-0.68□□□□□ -2.52
SPC1P46965 URB1YKL014C 5295 nt-0.68□□□□□ -2.52
SPC1P46965 SNU56YDR240C 1479 nt-0.68□□□□□ -2.52
SPC1P46965 HAL9YOL089C 3093 nt-0.68□□□□□ -2.52
SPC1P46965 NIP1YMR309C 2439 nt-0.69□□□□□ -2.52
SPC1P46965 SPC24YMR117C 642 nt-0.69□□□□□ -2.52
SPC1P46965 YAP6YDR259C 1152 nt-0.7□□□□□ -2.52
SPC1P46965 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt-0.7□□□□□ -2.52
SPC1P46965 YOR345CYOR345C 351 nt-0.7□□□□□ -2.52
SPC1P46965 TAH1YCR060W 336 nt-0.71□□□□□ -2.52
SPC1P46965 HTB2YBL002W 396 nt-0.71□□□□□ -2.52
SPC1P46965 ASE1YOR058C 2658 nt-0.71□□□□□ -2.52
SPC1P46965 ACF4YJR083C 930 nt-0.72□□□□□ -2.52
SPC1P46965 ATG16YMR159C 453 nt-0.73□□□□□ -2.53
SPC1P46965 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-0.73□□□□□ -2.53
SPC1P46965 YBR206WYBR206W 324 nt-0.73□□□□□ -2.53
SPC1P46965 MYO1YHR023W 5787 nt-0.75□□□□□ -2.53
SPC1P46965 CWC23YGL128C 852 nt-0.75□□□□□ -2.53
SPC1P46965 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-0.75□□□□□ -2.53
SPC1P46965 YPL205CYPL205C 345 nt-0.75□□□□□ -2.53
SPC1P46965 PBI2YNL015W 228 nt-0.76□□□□□ -2.53
SPC1P46965 YDR220CYDR220C 294 nt-0.77□□□□□ -2.53
SPC1P46965 POL32YJR043C 1053 nt-0.77□□□□□ -2.53
SPC1P46965 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.77□□□□□ -2.53
SPC1P46965 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.77□□□□□ -2.53
SPC1P46965 YOR248WYOR248W 303 nt-0.77□□□□□ -2.53
SPC1P46965 YCR022CYCR022C 345 nt-0.78□□□□□ -2.53
SPC1P46965 YER188C-AYER188C-A 300 nt-0.78□□□□□ -2.53
SPC1P46965 LOC1YFR001W 615 nt-0.78□□□□□ -2.53
SPC1P46965 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.78□□□□□ -2.53
SPC1P46965 YIR044CYIR044C 186 nt-0.79□□□□□ -2.54
SPC1P46965 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.79□□□□□ -2.54
SPC1P46965 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-0.79□□□□□ -2.54
SPC1P46965 YOL160WYOL160W 342 nt-0.79□□□□□ -2.54
SPC1P46965 RPM2YML091C 3609 nt-0.79□□□□□ -2.54
SPC1P46965 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.8□□□□□ -2.54
SPC1P46965 UBS1YBR165W 834 nt-0.81□□□□□ -2.54
SPC1P46965 VAM3YOR106W 852 nt-0.82□□□□□ -2.54
SPC1P46965 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.83□□□□□ -2.54
SPC1P46965 YML108WYML108W 318 nt-0.83□□□□□ -2.54
SPC1P46965 RPL22BYFL034C-A 369 nt-0.84□□□□□ -2.54
SPC1P46965 ILM1YJR118C 612 nt-0.84□□□□□ -2.54
SPC1P46965 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-0.84□□□□□ -2.54
SPC1P46965 YPL261CYPL261C 309 nt-0.84□□□□□ -2.54
SPC1P46965 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.85□□□□□ -2.55
SPC1P46965 IRC16YPR038W 360 nt-0.85□□□□□ -2.55
SPC1P46965 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.86□□□□□ -2.55
SPC1P46965 EMC4YGL231C 573 nt-0.86□□□□□ -2.55
SPC1P46965 ECL1YGR146C 636 nt-0.86□□□□□ -2.55
SPC1P46965 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.86□□□□□ -2.55
SPC1P46965 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.86□□□□□ -2.55
SPC1P46965 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.86□□□□□ -2.55
SPC1P46965 YLR171WYLR171W 390 nt-0.86□□□□□ -2.55
SPC1P46965 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-0.86□□□□□ -2.55
SPC1P46965 PTP2YOR208W 2253 nt-0.86□□□□□ -2.55
SPC1P46965 snR72snR72 98 nt-0.88□□□□□ -2.55
SPC1P46965 DCP1YOL149W 696 nt-0.88□□□□□ -2.55
SPC1P46965 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.89□□□□□ -2.55
SPC1P46965 SRB7YDR308C 423 nt-0.9□□□□□ -2.55
SPC1P46965 YGL015CYGL015C 393 nt-0.91□□□□□ -2.56
SPC1P46965 TIM13YGR181W 318 nt-0.91□□□□□ -2.56
SPC1P46965 IPP1YBR011C 864 nt-0.91□□□□□ -2.56
SPC1P46965 DIE2YGR227W 1578 nt-0.91□□□□□ -2.56
SPC1P46965 YPR096CYPR096C 303 nt-0.92□□□□□ -2.56
SPC1P46965 YGL239CYGL239C 315 nt-0.93□□□□□ -2.56
SPC1P46965 YNL319WYNL319W 441 nt-0.93□□□□□ -2.56
SPC1P46965 YKL202WYKL202W 582 nt-0.94□□□□□ -2.56
SPC1P46965 YGR115CYGR115C 780 nt-0.95□□□□□ -2.56
SPC1P46965 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-0.95□□□□□ -2.56
SPC1P46965 snR34snR34 203 nt-0.95□□□□□ -2.56
SPC1P46965 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.96□□□□□ -2.56
SPC1P46965 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.96□□□□□ -2.56
SPC1P46965 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.98□□□□□ -2.57
SPC1P46965 BUD26YDR241W 288 nt-1□□□□□ -2.57
SPC1P46965 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-1.01□□□□□ -2.57
SPC1P46965 APQ13YJL075C 417 nt-1.01□□□□□ -2.57
SPC1P46965 snR33snR33 183 nt-1.01□□□□□ -2.57
SPC1P46965 snR51snR51 107 nt-1.01□□□□□ -2.57
SPC1P46965 YPR039WYPR039W 336 nt-1.02□□□□□ -2.57
SPC1P46965 MRPS8YMR158W 468 nt-1.03□□□□□ -2.57
SPC1P46965 snR161snR161 161 nt-1.03□□□□□ -2.57
SPC1P46965 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-1.04□□□□□ -2.58
SPC1P46965 ATG31YDR022C 591 nt-1.04□□□□□ -2.58
SPC1P46965 YLR287CYLR287C 1068 nt-1.04□□□□□ -2.58
SPC1P46965 BER1YLR412W 825 nt-1.04□□□□□ -2.58
SPC1P46965 RPS20YHL015W 366 nt-1.05□□□□□ -2.58
SPC1P46965 YJL120WYJL120W 324 nt-1.05□□□□□ -2.58
SPC1P46965 YOL029CYOL029C 606 nt-1.05□□□□□ -2.58
SPC1P46965 SGF11YPL047W 300 nt-1.05□□□□□ -2.58
SPC1P46965 YBR099CYBR099C 384 nt-1.05□□□□□ -2.58
SPC1P46965 snR36snR36 182 nt-1.05□□□□□ -2.58
SPC1P46965 RPF1YHR088W 888 nt-1.06□□□□□ -2.58
SPC1P46965 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-1.06□□□□□ -2.58
SPC1P46965 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-1.06□□□□□ -2.58
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