Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD4P46934 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms