Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRCC3P46736 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms