Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NOP2P46087 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NOP2P46087 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NOP2P46087 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NOP2P46087 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NOP2P46087 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NOP2P46087 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NOP2P46087 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NOP2P46087 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NOP2P46087 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NOP2P46087 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NOP2P46087 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NOP2P46087 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NOP2P46087 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NOP2P46087 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP2P46087 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP2P46087 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms