Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NKX2-1P43699 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms