Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCAMP43121 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCAMP43121 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCAMP43121 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCAMP43121 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCAMP43121 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCAMP43121 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCAMP43121 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCAMP43121 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCAMP43121 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MCAMP43121 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCAMP43121 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCAMP43121 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCAMP43121 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCAMP43121 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCAMP43121 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCAMP43121 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCAMP43121 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms