Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA7P36544 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms