Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6V1E1P36543 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP6V1E1P36543 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms