Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT3P35638 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms