Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCN1P35523 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCN1P35523 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms