Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJA4P35212 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJA4P35212 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJA4P35212 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJA4P35212 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJA4P35212 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GJA4P35212 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms