Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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