Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC27P30260 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC27P30260 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC27P30260 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC27P30260 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC27P30260 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC27P30260 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC27P30260 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC27P30260 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC27P30260 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC27P30260 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC27P30260 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC27P30260 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC27P30260 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC27P30260 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC27P30260 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC27P30260 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC27P30260 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC27P30260 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC27P30260 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC27P30260 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC27P30260 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC27P30260 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC27P30260 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC27P30260 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC27P30260 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC27P30260 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC27P30260 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC27P30260 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC27P30260 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC27P30260 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC27P30260 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC27P30260 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC27P30260 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC27P30260 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC27P30260 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC27P30260 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC27P30260 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC27P30260 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC27P30260 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC27P30260 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC27P30260 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC27P30260 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC27P30260 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC27P30260 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC27P30260 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC27P30260 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC27P30260 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC27P30260 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms