Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCAP28676 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCAP28676 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCAP28676 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GCAP28676 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCAP28676 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCAP28676 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCAP28676 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCAP28676 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCAP28676 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCAP28676 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCAP28676 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCAP28676 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCAP28676 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCAP28676 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCAP28676 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCAP28676 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GCAP28676 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCAP28676 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCAP28676 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GCAP28676 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCAP28676 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCAP28676 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCAP28676 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCAP28676 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GCAP28676 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GCAP28676 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms