Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRB3P28472 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRB3P28472 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRB3P28472 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRB3P28472 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRB3P28472 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRB3P28472 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRB3P28472 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRB3P28472 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRB3P28472 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRB3P28472 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRB3P28472 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRB3P28472 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABRB3P28472 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABRB3P28472 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms