Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD10P28358 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD10P28358 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms