Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGA3P26006 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms