Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSSP25774 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTSSP25774 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSSP25774 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSSP25774 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms