Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms