Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VDAC1P21796 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VDAC1P21796 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms