Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CD247P20963 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CD247P20963 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CD247P20963 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CD247P20963 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD247P20963 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CD247P20963 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD247P20963 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD247P20963 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD247P20963 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CD247P20963 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD247P20963 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD247P20963 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD247P20963 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD247P20963 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD247P20963 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD247P20963 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD247P20963 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD247P20963 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD247P20963 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CD247P20963 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD247P20963 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD247P20963 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD247P20963 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CD247P20963 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms