Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA1P20827 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms