Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2B1P20020 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms