Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMY2BP19961 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMY2BP19961 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms