Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLP19338 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLP19338 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLP19338 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLP19338 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLP19338 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLP19338 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLP19338 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLP19338 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLP19338 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLP19338 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCLP19338 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCLP19338 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCLP19338 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCLP19338 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCLP19338 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCLP19338 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCLP19338 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCLP19338 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms