Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD44P16070 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD44P16070 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD44P16070 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD44P16070 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD44P16070 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD44P16070 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD44P16070 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD44P16070 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms