Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD8P13378 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD8P13378 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms