Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEFHP12036 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEFHP12036 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEFHP12036 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEFHP12036 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NEFHP12036 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NEFHP12036 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEFHP12036 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFHP12036 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFHP12036 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFHP12036 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFHP12036 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFHP12036 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFHP12036 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFHP12036 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFHP12036 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFHP12036 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEFHP12036 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms