Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms