Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM6P0DI80 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms