Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN2P0C2S0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTXN2P0C2S0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN2P0C2S0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN2P0C2S0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN2P0C2S0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN2P0C2S0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN2P0C2S0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN2P0C2S0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN2P0C2S0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN2P0C2S0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN2P0C2S0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN2P0C2S0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN2P0C2S0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN2P0C2S0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN2P0C2S0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms