Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOA4P06727 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOA4P06727 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOA4P06727 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOA4P06727 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOA4P06727 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOA4P06727 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOA4P06727 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOA4P06727 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOA4P06727 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOA4P06727 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOA4P06727 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA4P06727 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA4P06727 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA4P06727 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA4P06727 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA4P06727 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA4P06727 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA4P06727 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA4P06727 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA4P06727 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA4P06727 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA4P06727 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA4P06727 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOA4P06727 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms