Protein–RNA interactions for Protein: P04035

HMGCR, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCRP04035 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGCRP04035 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCRP04035 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCRP04035 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGCRP04035 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms