Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PF4P02776 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4P02776 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4P02776 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4P02776 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4P02776 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms