Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HBE1P02100 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBE1P02100 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBE1P02100 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HBE1P02100 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBE1P02100 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBE1P02100 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HBE1P02100 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HBE1P02100 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HBE1P02100 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HBE1P02100 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms