Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUDT3O95989 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUDT3O95989 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUDT3O95989 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUDT3O95989 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUDT3O95989 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUDT3O95989 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUDT3O95989 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUDT3O95989 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUDT3O95989 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NUDT3O95989 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NUDT3O95989 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NUDT3O95989 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NUDT3O95989 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms