Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POP4O95707 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POP4O95707 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POP4O95707 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POP4O95707 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POP4O95707 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POP4O95707 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POP4O95707 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POP4O95707 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POP4O95707 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POP4O95707 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms