Protein–RNA interactions for Protein: O95274

LYPD3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD3O95274 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LYPD3O95274 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms