Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SKAP2O75563 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms