Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINK4O60575 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINK4O60575 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms