Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN3BO60391 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms