Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
KIAA0556O60303 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms