Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOX15O60248 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX15O60248 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms