Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBFA2T2O43439 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBFA2T2O43439 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms