Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRRTM2O43300 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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